Motif-Quest: Desenvolvimento de uma Ferramenta de Bioinformática para Análise de Marcadores Microssatélites
Author:
Marques, Cassiano Eric de Carvalho
Abstract:
Microssatélites (SSRs), ou Repetições de Sequências Simples, são marcadores moleculares co-dominantes e multialélicos, amplamente utilizados em estudos de mapeamento genético, diversidade populacional e genômica evolutiva. A identificação precisa e eficiente desses locos em grandes volumes de dados de sequenciamento é uma etapa fundamental na pesquisa genética, demandando ferramentas computacionais que sejam ao mesmo tempo robustas e acessíveis. Para atender a essa necessidade, foi desenvolvido o software Motif-Quest, uma ferramenta de bioinformática com interface web interativa, implementada em Python com o auxílio da biblioteca Streamlit. A aplicação automatiza a prospecção de microssatélites perfeitos (de mono a hexanucleotídeos e comprimentos personalizados) e compostos, permitindo que o usuário personalize de forma flexível os parâmetros de busca, como o número mínimo de repetições e a distância máxima entre locos adjacentes. O Motif-Quest aceita sequências de DNA em formato FASTA, processa os dados e apresenta os resultados em uma tabela detalhada, acompanhada de uma visualização gráfica interativa que mapeia a posição dos SSRs ao longo das sequências analisadas. O software visa otimizar o fluxo de trabalho de pesquisadores na área da genética, oferecendo uma solução completa e de fácil utilização que vai desde a entrada de dados brutos até a exportação de resultados formatados, representando uma contribuição prática para o avanço das análises genômicas.
Description:
Universidade Federal de Santa Catarina Centro de Ciências Agrárias Laboratório de Fisiologia do Desenvolvimento e Genético Vegetal Departamento de Fitotecnia Do Centro de Ciências Agrárias (CCA)