Motif-Quest: Desenvolvimento de uma Ferramenta de Bioinformática para Análise de Marcadores Microssatélites
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| dc.contributor |
Universidade Federal de Santa Catarina |
pt_BR |
| dc.contributor.advisor |
Stefenon, Valdir Marcos |
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| dc.contributor.author |
Marques, Cassiano Eric de Carvalho |
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| dc.date.accessioned |
2025-09-09T14:15:31Z |
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| dc.date.available |
2025-09-09T14:15:31Z |
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| dc.date.issued |
2025-09-08 |
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| dc.identifier.uri |
https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/268493 |
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| dc.description |
Universidade Federal de Santa Catarina Centro de Ciências Agrárias Laboratório de Fisiologia do Desenvolvimento e Genético Vegetal Departamento de Fitotecnia Do Centro de Ciências Agrárias (CCA) |
pt_BR |
| dc.description.abstract |
Microssatélites (SSRs), ou Repetições de Sequências Simples, são marcadores moleculares co-dominantes e multialélicos, amplamente utilizados em estudos de mapeamento genético, diversidade populacional e genômica evolutiva. A identificação precisa e eficiente desses locos em grandes volumes de dados de sequenciamento é uma etapa fundamental na pesquisa genética, demandando ferramentas computacionais que sejam ao mesmo tempo robustas e acessíveis. Para atender a essa necessidade, foi desenvolvido o software Motif-Quest, uma ferramenta de bioinformática com interface web interativa, implementada em Python com o auxílio da biblioteca Streamlit. A aplicação automatiza a prospecção de microssatélites perfeitos (de mono a hexanucleotídeos e comprimentos personalizados) e compostos, permitindo que o usuário personalize de forma flexível os parâmetros de busca, como o número mínimo de repetições e a distância máxima entre locos adjacentes. O Motif-Quest aceita sequências de DNA em formato FASTA, processa os dados e apresenta os resultados em uma tabela detalhada, acompanhada de uma visualização gráfica interativa que mapeia a posição dos SSRs ao longo das sequências analisadas. O software visa otimizar o fluxo de trabalho de pesquisadores na área da genética, oferecendo uma solução completa e de fácil utilização que vai desde a entrada de dados brutos até a exportação de resultados formatados, representando uma contribuição prática para o avanço das análises genômicas. |
pt_BR |
| dc.format.extent |
Vídeo |
pt_BR |
| dc.language.iso |
por |
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| dc.publisher |
Florianópolis, SC |
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| dc.subject |
Marcadores moleculares |
pt_BR |
| dc.subject |
Melhoramento genético |
pt_BR |
| dc.subject |
Sequênciamento de nova geração |
pt_BR |
| dc.subject |
Python |
pt_BR |
| dc.subject |
Motif-Quest |
pt_BR |
| dc.title |
Motif-Quest: Desenvolvimento de uma Ferramenta de Bioinformática para Análise de Marcadores Microssatélites |
pt_BR |
| dc.title.alternative |
Motif-Quest: Desenvolvimento de uma Ferramenta de Bioinformática para Análise de Marcadores Microssatélites |
pt_BR |
| dc.type |
video |
pt_BR |
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