Análise in silico de mutações em genes envolvidos na obesidade

Abstract

A plataforma Clinvar é uma plataforma que agrega dados públicos de variantes genômicas humanas e interpretações de suas relações com doenças e outras condições. Cada um dos registros na plataforma inclui descrição detalhada da variante ou conjunto de variantes que foi interpretada, a condição e interpretação da variante, a interpretação do significado clínico da variante e as provas do requerente para essa interpretação, estruturadas como observações da variante. Este trabalho se baseia na mineração de dados, tipo de estudo que visa encontrar padrões e correlações em grandes conjuntos de dados, objetivando a obtenção de resultados. Para isto, utilizou-se da plataforma Clinvar, que como já citado anteriormente têm mais de 825.000 registros. Tendo como chave de busca avançada a palavra “Obesity” consegue-se extrair 467 resultados, dos quais selecionou-se aqueles identificados como deletérios, diminuindo assim nossos resultados para 20 mutações em 7 genes diferentes. Com objetivo de ainda reduzir estes achados, para enfoque nos de maior importância, utilizamos de plataformas de predição que foram capazes de identificar apenas 16 das mutações como tendo significância, ou resultados deletérios. A plataforma HOPE analisou os resíduos mutantes e forneceu informações sobre tamanho do resíduo mutante, resíduo mais hidrofóbico, conservação de resíduos do tipo selvagem e danos, os quais utilizamos para melhor embasamento de nosso entendimento. Por fim, para que pudéssemos estabelecer melhor uma relação entre essas mutações e a realidade da população brasileira, 2 plataformas brasileiras (ABraOM e SELAdb) foram utilizadas, que identificaram 4 mutações como sendo relevantes sendo elas dos SNPs L72M e R51Q do gene GHRL; nsSNP R70W do gene UCP3 e nsSNP T150I do gene MC4R. Este estudo foi o primeiro realizado por este grupo de pesquisa, pelos achados deste, cria-se perspectivas futuras sobre a caracterização e entendimento dessas mutações e genes para um melhor entendimento da fisiopatologia da obesidade.