Identificação molecular por DNA barcoding de espécies comercializadas em casquinhas de siri no estado de Santa Catarina

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Identificação molecular por DNA barcoding de espécies comercializadas em casquinhas de siri no estado de Santa Catarina

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Title: Identificação molecular por DNA barcoding de espécies comercializadas em casquinhas de siri no estado de Santa Catarina
Author: Cassol, Sophia
Abstract: A família Portunidae abrange 307 espécies de animais conhecidos popularmente como “siris” e é notável pelo seu grande potencial na pesca e aquicultura mundial. O estado de Santa Catarina apresenta a ocorrência de 13 espécies, sendo reconhecido o potencial pesqueiro do gênero Callinectes. Os siris são comercializados individualmente sem os apêndices, apenas a carne ou o exoesqueleto vazio para a produção de “casquinhas de siri”. Por ser um alimento altamente processado, na hora do consumo a identificação das espécies utilizadas no preparo torna-se difícil, exigindo um método molecular para a identificação. O DNA barcoding é uma técnica que utiliza uma pequena sequência de DNA, geralmente o gene mitocondrial COI em animais, que permite a identificação da espécie, utilizando uma amostra, que pode ser comparada com um banco de dados. O objetivo desse estudo foi identificar as espécies presentes em casquinhas de siri comercializadas em Santa Catarina através do DNA barcoding. As amostras, obtidas em peixarias, foram fracionadas e armazenadas em freezer até o momento da extração do DNA. Após a extração, as amostras foram amplificadas por PCR seguindo dois protocolos, os quais diferem principalmente nas concentrações de dNTP, MgCl2 e primers. Os produtos foram visualizados por eletroforese e seguiram para purificação e sequenciamento. As sequências obtidas foram comparadas com bancos de dados. Duas espécies de siris foram identificadas em 19 das 20 amostras. Também foram analisadas amostras de mistura intencional de siri com duas espécies de peixe e duas espécies de outros invertebrados. Para estas amostras evidenciou-se a ineficácia da técnica de sequenciamento utilizada. Os rótulos das embalagens foram analisados e 80% não apresentou todas as informações necessárias previstas na legislação. Ainda são necessários mais estudos que empreguem outras técnicas para casquinhas de siri que contenham mistura de espécies e mais esforços para coleta de dados sobre a pesca e ações de conservação das espécies deste grupo.Portunidae family consists of 307 species of animals known as "swimming crabs" and is notable for its great potential in world fishery and aquaculture. Thirteen species have been described from the state of Santa Catarina and the genus Callinectes is recognized for its fishing potential. Swimming crabs are marketed individually without appendages, only meat or the empty exoskeleton for production of "stuffed swimming crab shells". Because it is a highly processed food, at the time of consumption the identification of the species used in the preparation becomes difficult, requiring a molecular method for identification. DNA barcoding is a technique that uses a small DNA sequence, usually the mitochondrial COI gene in animals, which allows the identification of species using a sample that can be compared to a database. The aim of this study was to identify the species in stuffed swimming crab shells marketed in Santa Catarina through DNA barcoding. The samples, obtained from fish markets, were fractionated and stored in freezer until the moment of DNA extraction. After extraction, the samples were amplified by PCR following two protocols, which differ in dNTP, MgCl2 and primers concentrations. The products were visualized by electrophoresis and then were purificated and sequenced. The sequences were compared to databases. Two species of swimming crabs were identified in 19 of the 20 samples. Intentional mixed samples of swimming crab with two species of fish and two species of other invertebrates were analyzed. For these samples the inefficacy of the sequencing technique was evidenced. Packaging labels were analyzed and 80% did not provide all the information required by the legislation. Other techniques for mixed samples analysis, efforts to collect data of the fishery and conservation actions for this group underscore the need for additional studies.
Description: TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.
URI: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/192277
Date: 2018-11-27


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