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Devido à grave pandemia causada pela alta transmissão do novo coronavírus (SARS-CoV-2) e pela prevalência da variante Omicron no Estado de Santa Catarina durante o período de 2021 e 2022, fez-se necessária a investigação detalhada da informação genética dessas variantes do vírus que circulam em nosso Estado. Os dados desse projeto compreendem esse período. Nesse trabalho, mais de 700 genomas foram analisados e as informações em níveis protéicos foram sumarizadas, com foco na proteína Spike e M, relevantes para o processo de infecção viral. Foram encontradas 17 mutações compartilhadas na proteína Spike (D614G, H655Y, N679K, Q954H, N969K, D796Y, G339D, T478K, E484A, Q493R, N440K, S375F, S373P, Y505H, Q498R, S477N, N501Y.), 10 exclusivas a BA.2 (T19I, A27S, D405N, T376A, R408S, V213S, G142D, S371F, L5F, N764Y) e 13 (T95I, A67V, P681H, N856K, L981F, T547K, G496S, G446S, S371L, N764K, R346K, L212I,Y145D) únicas da BA.1. O grande número de mutações presentes na proteína Spike, estão relacionadas a transmissão mais rápida da variante Ômicron. No estado de Santa Catarina, a análise e vigilância de variantes de preocupações mostrou que pouco tempo depois de seu surgimento, a variante Ômicron tornou-se a VOC mais predominante no estado e está relacionada com o maior número de casos, mas não o número de mortes. A Ômicron pode escapar da imunidade das vacinas, reduzindo a potência dos anticorpos neutralizantes. Além disso, foi observado uma distribuição temporal, onde após o surgimento da Ômicron BA.1, a escalada dessa variante foi seguida pela sub linhagem BA.2 |
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