Métodos de Delimitação de Espécies aplicados ao gênero Jania de macroalgas marinhas vermelhas II: Poisson Tree Process e Statistical Parsimony Network

Abstract

Jania é um gênero de alga marinha vermelha calcária da ordem Corallinales (Rhodophyta) distribuído em todos os oceanos tropicais e temperados do mundo. Devido a alta diversidade morfológica apresentada pelas espécies desse gênero, sua taxonomia é de difícil resolução. Dessa maneira, o uso de ferramentas moleculares capazes de ajudar a resolver problemas taxonômicos é crucial para o avanço do entendimento da diversidade biológica dentro de Jania. Este trabalho foi baseado em dados moleculares ainda não publicados (= sequências de DNA de dois marcadores genéticos: cox1 e psbA). O trabalho foi direcionado a responder quantas espécies moleculares distintas de Jania existem na Austrália eu qual a relação filogenética entre elas. Ao longo deste estudo, realizei uma revisão bibliográfica de Jania e desenvolvi proficiências na edição de cromatogramas eletroforéticos, controle de qualidade de sequências de DNA, alinhamentos das sequências de DNA com demais sequências de Jania (e outras Corallinophycidae) disponíveis em bancos de dados públicos (GenBank), análises filogenéticas utilizando os métodos de Neighbor-Joining e máxima verossimilhança, e dois métodos de delineamentos de espécies: Poisson Tree Process e Statistical Parsimony Network. Com isso concluímos que: os métodos de delineamento de espécies reconheceram 6 espécies para o sul da Austrália: J. micrarthodia, J. sagittata, J. verrucosa, e 3 linhagens de J. rosea. Análises filogenéticas de cox1 reconheceram 5 espécies: J. micrarthodia; J. sagittata; J. adhaerens e 2 clados morfologicamente identificados como J. rosea. Apesar dos vários resultados obtidos, esse estudo representa apenas um passo para sabermos a verdadeira diversidade genética do gênero Jania na Australia e no mundo. O próximo passo é adicionar espécies brasileiras as nossas análises. A bolsa de PIBIC permitiu com que eu desenvolvesse diversas proficiências no uso de vários softwares de bioinformática e manuseio de bancos de dados digitais, tais como: Geneious, Blast, CIPRES, Poisson Tree Process, Statistical Parsimony Network no TCS, RAxML, Adobe Illustrator, assim as teorias por de trás destas ferramentas.