Análise filogenética de Pipridae (AVES: Passeriformes) incorporando caracteres sonoros

Abstract

Estudos filogenéticos foram muito afetados pelo advento da genômica. Como apenas gênes ortólogos podem ser utilizados para inferir relações filogenéticas, e muitos caracteres evolutivamente significantes não estão codificados no genoma, críticas ao uso exclusivo de sequências gênicas para estudos filogenéticos estiveram em alta nos últimos anos. A bioacústica entra em cena como uma fonte importante de caracteres de transmissão intraespecífica não codificados no genoma, e altamente susceptiveis a forças evolutivas como seleção sexual e deriva. Uma matriz foi construida com 19 espécies de Pipridae, incluindo representantes de todos os gêneros da família, exceto Manacus, e 17 caracteres de chamado (9 caracteres binários e 8 caracteres multi-estado não ordenados), do chamado de marcar de tais espécies. Arquivos de audio foram obtidos do Arquivo Bioacústico Catarinense, Wikiaves, Xeno-chamado e Macaulay Library, e consistiram de gravações de diferentes localidades para incluir variações geográficas intra-específicas. Caracteres foram polarizados por análise de grupo taxonômico externo com espécies de Tyrannidae e Cotingidae. Filogenias foram feitas com o programa TNT utilizando a matriz sonora junto a outras contendo caracteres morfológicos e comportamentais. Uma árvore consenso foi gerada com as duas árvores igualmente mais parcimoniosas. Os resultados colocaram o grupo Machaeropterus dentro da tribo Manacini. Houve alteração na posição de Heterocercus e Dixiphia, uma politomia no gênero Corapipo e um rearranjo no gênero Chiroxiphia dividindo-o em dois subgêneros, Chiroxiphia (Chiroxiphia) e Chiroxiphia (Lanceolata).

Phylogenetic studies have been largely affected by the advent of genomics. Since only orthologous genes can be used to infer phylogenetic relationships, and many evolutionary significant characters are not encoded in the genome, critics on the use of genome sequences alone for phylogenetic studies have been on the rise over the past years. Bioacoustics enters the scene as an important source of intraspecifc transmittable characters not encoded in the genome, and highly susceptible to evolutionary forces such as sexual selection and drift. A matrix was constructed with 19 species of Pipridae, including representatives of all genera of the family, except for Manacus, and 17 song characters (9 binary characters and 8 unordered multi-state characters), of the advertisement call of such species. Audio files were collected from Arquivo Bioacústico Catarinense, Wikiaves, Xeno- chamado and Macaulay Library, and consisted of recordings from different localities to account for intraspecifc geographic variations. Characters were polarized by out-group comparison method with species of Tyrannidae and Contigidae. Phylogenies were made with TNT using the song matrix coupled with others based on morphological and behavioral characters. A strict consensus tree was generated with the two most parsimonious trees. The results put the Machaeropterus group inside of the Manacini tribe. There was a change in the position of Heterocercus and Dixiphia, a politomy in the Corapipo genus and a rearrangement in the Chiroxiphia genus dividing it into two subgenera, Chiroxiphia (Chiroxiphia) and Chiroxiphia (Lanceolata).