Transferibilidade de marcadores SSR desenvolvidos para Plinia trunciflora (O.Berg) Kausel e Plinia cauliflora (Mart.) Kausel para espécies de Myrtaceae

Abstract

A família Myrtaceae é caracterizada pela elevada riqueza de espécies e importância nas formações vegetais. Com isso, estudos genéticos são valiosos para subsidiar práticas de manejo, conservação e usos de recursos genéticos de Myrtaceae. Nesse contexto, marcadores moleculares SSR ou microssatélites mostram-se vantajosos para estes estudos genéticos. Essa classe de marcador corresponde a sequências de DNA formadas por 1 a 6 pares de nucleotídeos que se repetem lado a lado, podendo estar presentes em regiões codantes e não codantes. Estes marcadores tornam-se importantes, principalmente pelo elevado nível de polimorfismo, multialelismo e alta reprodutibilidade. Desse modo, este estudo objetivou verificar a transferibilidade de 10 marcadores SSR desenvolvidos para P. trunciflora e 10 para P. cauliflora em espécies de Myrtaceae, assim como em Eucalyptus sp. Para isso, foram selecionadas treze espécies pertencentes aos gêneros Campomanesia, Eugenia, Psidium, Myrciaria, Syzygium e Eucalyptus. O DNA genômico total foi isolado seguindo o protocolo CTAB e as PCR foram realizadas em termociclador Veriti da Applied Biosystems® com volume final de 15 μL. Os produtos resultantes das reações de PCR foram verificados em gel de agarose 3%. O tamanho dos fragmentos de DNA amplificados foi estimado por comparação com um marcador de peso molecular de 100 pb. Os resultados demonstram que, dentre os 20 marcadores testados, 14 resultaram em amplificações em pelo menos uma espécie. Além disso, é possível inferir que os marcadores desenvolvidos em Plinia trunciflora se mostraram mais bem sucedidos nos testes de verificação de transferibilidade para outras espécies da família Myrtaceae.

The Myrtaceae family is characterized by its high species richness and importance in plant formations.Therefore, genetic studies are valuable to support management practices, conservation, and use of Myrtaceae genetic resources. In this context, SSR molecular markers or microsatellites are advantageous for these genetic studies. This class of marker corresponds to DNA sequences formed by 1 to 6 pairs of nucleotides that repeat side by side, and may be present in coding and non-coding regions. These markers become important, mainly due to the high level of polymorphism, multiallelism and high reproducibility. Thus, this study aimed to verify the transferability of 10 SSR markers developed for P. trunciflora and 10 for P. cauliflora in Myrtaceae species native to the Atlantic Forest, as well as in Eucalyptus sp. For this purpose, thirteen species belonging to the genre Campomanesia, Eugenia, Psidium, Myrciaria, Syzygium and Eucalyptus were selected. Total genomic DNA was isolated following the CTAB protocol and PCRs were performed in an Applied Biosystems® Veriti thermocycler with a final volume of 15 μL. The products resulting from the PCR reactions were verified on a 3% agarose gel. The size of the amplified DNA fragments was estimated by comparison with a 100 bp molecular weight marker. The results demonstrate that, among the 20 markers tested, 14 resulted in amplifications in at least one species. Furthermore, it is possible to infer that the markers developed in P. trunciflora were more successful in the transferability verification tests to other species of the Myrtaceae family.