A GEP, Gerência de Ensino e Pesquisa do Hospital Universitário Polydoro Ernani de São Thiago da Universidade Federal de Santa Catarina, administrado pela Empresa Brasileiras de Serviços Hospitalares (HU-UFSC/Ebserh), está diretamente vinculada à Superintendência. A GEP tem como objetivo primordial organizar, aprimorar, otimizar, fomentar e padronizar as atividades de ensino, pesquisa e extensão no HU/UFSC/Ebserh, contribuindo com o propósito institucional “Ensinar para transformar o cuidar”.