Padrões genotípicos de cultivares de alho (Allium sativum L.) do Planalto Catarinense caracterizadas por marcadores microssatélites

Abstract

O alho é uma cultura amplamente consumida em todo o mundo e corresponde a parte importante da economia e da alimentação no Brasil. A produção dessa cultura é uma alternativa de renda interessante para agricultores familiares, pois apresenta um rendimento considerável em áreas pequenas, ainda que exija muitos cuidados no manejo. O Planalto Catarinense é uma região importante na produção de alho e torna o estado de Santa Catarina o 3º maior produtor do Brasil, competindo diretamente com o alho argentino no mercado nacional. Devido a seu tipo de propagação assexuada, estudo em nível molecular da cultura, se faz interessante para compreender a frequência de mutações que permitem a seleção e otimização da produção, além da valorização do produto de agricultores locais. Foram utilizados 12 marcadores moleculares SSR para a análise da diferença genética de 8 cultivares coletadas no Planalto Catarinense e estimado sua diversidade genética por meio de diferentes índices de diversidade, como número total de alelos, número efetivo de alelos, índice de Shannon, heterozigosidade esperada, heterozigosidade observada, análise da variância molecular, distância genética de Nei e análise de coordenadas principais. Os resultados finais são referentes a somente 4 marcadores e mostraram diferença genética entre cultivares, no entanto, para maior qualidade nos resultados obtidos, são necessárias análises complementares com maior número de marcadores moleculares.

The garlic is a widely consumed crop around the world and corresponds to an important part of the Brazilian economy and feeding. This crop production is an interesting income alternative for family farmers, because garlic has considerable yield in small areas, even though it needs special handling. The Planalto Catarinense is an important region for the garlic production and it makes Santa Catarina the 3rd largest producer in Brazil, competing directly with Argentinian garlic. Due to its asexual propagation type, studies at molecular level are interesting to understand the frequency of mutations that allows the selection and optimization of the production, in addition valorization of the product of local farmers. Twelve SSR molecular markers were used for the analysis of 8 cultivars collected in Planalto Catarinense and estimated genetic diversity from indexes for total allele numbers, effective allele numbers, Shannon index, expected heterozygosity, observed heterozygosity, molecular variance analysis, Nei's standard genetic distance and Principal Coordinates Analysis. The final results are from only 4 markers and they showed genetic differences between cultivars, however for better results in this research, it is necessary to make a complementary analysis with a bigger number of molecular markers. Index terms: SSR markers; allelic patterns; genetic diversity; genetic sequencing