Filogenia de genes da superfamília dos receptores nucleares em espécies aquáticas

Abstract

Os ambientes aquáticos estão entre os mais ameaçados pela contaminação ambiental resultante de atividades antropogênicas. Entre os poluentes despejados nos corpos hídricos que mais causam preocupação estão os denominados desreguladores endócrinos (DE), que possuem a capacidade de alterar funções fisiológicas dos organismos, causando reações adversas no controle homeostático, desenvolvimento e reprodução. Devido a este cenário, faz-se cada vez mais necessária a identificação de novas moléculas biomarcadoras para o monitoramento ambiental. Dentre os diversos biomarcadores potenciais identificados até o momento, estão os receptores nucleares, uma superfamília de proteínas que atuam em diversas vias metabólicas, incluindo a neutralização de xenobióticos. Esses receptores estão presentes em todos os metazoários e possuem uma arquitetura similar entre si, apresentando regiões conservadas em suas sequências, como o domínio de ligação ao DNA (DBD) e o domínio de ligação ao ligante (LBD), essenciais para o desempenho das suas funções, bem como regiões menos conservadas. Levando em consideração a similaridade entre as sequências dos receptores nucleares, estudos filogenéticos podem ser realizados a fim de elucidar as relações evolutivas desses receptores entre as espécies aquáticas. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi realizar filogenias baseada em sequências de espécies de interesse conservacional, utilizando sequências aminoacídicas completas e sequências dos domínios DBD e LBD, além de criar modelos tridimensionais para esses domínios. Os resultados das análises filogenéticas indicaram topologias coerentes entre os grupos e famílias de receptores nucleares para todas as abordagens, podendo ajudar na identificação de genes ortólogos e futuras moléculas biomarcadoras, auxiliando também no monitoramento ambiental. As análises estruturais geraram modelos tridimensionais muito similares para cada domínio, reforçando a alta conservação dos domínios estudados. De modo geral foi feita uma comparação entre filogenias baseadas em sequências completas e em domínios, demonstrando que para os receptores nucleares é possível utilizar a última como alternativa, facilitando as análises filogenéticas e estruturais e reduzindo o custo computacional.