Exploração do uso de redes de Petri para estudo do desenvolvimento da vulva do Caernorhabditis elegans

Abstract

O pequeno verme C. elegans é considerado um dos melhores organismos modelo para investigações na neurobiologia e em muitos processos do desenvolvimento dos seres, como a apoptose (morte celular programada),a sinalização celular, a regulação gênica, o metabolismo, o envelhecimento e a determinação do sexo. Dentre os cenários estudados,a respeito deste verme, está o desenvolvimento da sua vulva. Tal processo fornece insights para mecanismos de formação de padrões durante o desenvolvimento do embrião (organogênese). Com o aumento no número de informações biológicas, obtidas através de avanços tecnológicos aplicados às pesquisas, tornou-se necessária a utilização de abordagens computacionais para unir e analisar o conhecimento obtido sobre o verme C. elegans. Sendo assim, este trabalho de mestrado apresenta um estudo sobre a fase L2 e L3 do desenvolvimento vulvar do verme C. elegans, e a construção de um modelo em rede de Petri para a fase L3. A efetividade do modelo proposto, foi demonstrada comparando os resultados das simulações na rede de Petri com experimentos in vivo.<br>

Abstract : The worm C. elegans is considered one of the best organism model for neurobiological research and for a variety of biological processes among which the apoptosis (programmed cell death), cell signaling, regulation of gene expression, metabolism, aging and the sex determination. Regarding this worm, among the cases studied, an especially important is the vulvar development. It provides insights of standard mechanisms for the embryo development (organogenesis). Based on the increasing amount of biological information obtained through the technological advances on the research eld, it becomes essential the usage of computational models to gather and analyze the knowledge regarding the worm C. elegans. This master dissertation presents a study relative to the L2 and L3 stage of the worm C. elegans vulvar development and the construction process of a Petri net model designed for the study of the L3 stage. The eectiveness of the given model is demonstrated comparing the results of Petri net simulations against in vivo experiments.