Caracterização in silico da superfamília de Receptores Nucleares em Crassostrea gigas (Thunberg, 1793)

Abstract

Constantemente produtos químicos são produzidos em larga escala e introduzidos no ambiente, contaminando principalmente os ecossistemas aquáticos. Uma vez que o número de xenobióticos é crescente, a demanda por estudos toxicológicos tornam as técnicas de testes in vivo difíceis de serem executadas. Há uma necessidade então do desenvolvimento de abordagens que selecionem e priorizem quais compostos devem passar por testes mais detalhados. Receptores nucleares (NRs) são tipicamente alvo de compostos sintéticos que imitam ou antagonizam a ação de ligantes endógenos. Nesse estudo propomos uma metodologia de caracterização estrutural de NRs para a ostra do pacífico, organismo sentinela e de importante interesse para zonas costeiras de Santa Catarina. Nossos resultados mostram que a partir de técnicas de modelagem comparativa e caracterização de cavidades é possível classificar NRs de um organismo não modelo em potencialmente moduladas e não moduladas. Apresentamos também uma alternativa promissora para triagem de ligantes com base nas características volumétricas do sítio ativo, com destaque especial para o NR CgROR que se mostrou favorável a interações com colesterol e tamoxifeno.