LAPOGE Database - estrutura relacional de banco de dados biológicos para armazenamento e sistematização de informações genéticas e epidemiológicas

Abstract

O Laboratório de Polimorfimos Genéticos – LAPOGE da UFSC foi implantado há 22 anos e é base para a formação de alunos de graduação e pós-graduação, além de estágios e vivências. O impressionante volume de dados gerados neste tempo fez crescer a necessidade de um sistema de organização dos dados coletados para todos os participantes das diversas pesquisas executadas neste tempo. Neste sentido, este trabalho propõe a implementação de um banco de dados relacional adequado ao LAPOGE, além do levantamento dos trabalhos realizados e questionários utilizados para levantamento de informações do participante doador da amostra. Durante o levantamento de dados, foi possível encontrar um total de 49 produções. Dentre estas, 34 trabalhos de conclusão de curso de graduação, 12 dissertações de mestrado e 3 teses de doutorado, que utilizaram um total de 158 marcadores. Além disso, notou-se uma grande quantidade de questionários diferentes gerados ao longo dos trabalhos; para garantir uma maior precisão na coleta de dados e diminuir a margem de erro, foram levantadas todas as perguntas comuns utilizadas durante a coleta dos dados biológicos e criado um novo questionário unificado e padronizado. O LAPOGEDb (LAPOGE Database) foi tabulado para armazenar dados em MySQL com interface PHP. Os dados são criptografados e o acesso é restrito a usuários com cadastro autorizado. Está depositado no servidor da Universidade Federal de Santa Catarina que executa três cópias diárias de segurança (backup). A estrutura relacional foi organizada em dez abas e a interface final é do tipo “amigável” onde não é exigido ao usuário nenhum conhecimento de programação. Foram implementadas as abas de Dados Pessoais, Dados Familiais, Dados Biológicos, Dados Epidemiológicos, Dados médicos, Marcadores genéticos, Amostra biológica e as abas específicas de Artrite, Psoríase, Lúpus e Câncer de Mama. O sistema de cadastro permite o acesso às informações, mas mantém sigilosas aquelas previstas pelo Comitê de Ética. A página de busca (que será implementada) permitirá coletar informações combinadas de todas as categorias e emitirá output em formato de uso para programas de análises. Dado o volume de informações, o LAPOGEDb inicia uma nova forma de organização e consulta de dados produzidos pelo LAPOGE UFSC.